¿Cuál es el mejor programa de facturación para autónomos?

La facturación es una de las tareas más importantes de un negocio. Por eso, necesitas que esté bien organizada, que sus procesos sean ágiles, eficientes y que estén adaptados a Verifactu y la facturación electrónica, sobre todo si eres autónomo.

Y ya puestos a pedir, si encima es gratis o tiene un precio ajustado, mejor que mejor.

Por eso, hoy te voy a contar lo que debe tener el mejor programa de facturación para autónomos y cómo elegir el que mejor encaje con tu actividad y tus necesidades.

¿Qué tienes que pedirle a tu programa de facturación en 2025?

Si estás buscando un software de facturación, ya no vale con que este sea útil y barato. Desde 2025, tiene que cumplir una serie de exigencias técnicas para adaptarse a la Ley Antifraude y al sistema VeriFactu.

Esto es lo que sí o sí tiene que cumplir tu programa de facturación:

• Integridad e inalterabilidad. El programa debe impedir que los datos de las facturas puedan ser alterados y eliminados. Solo se podrá corregir una factura emitida creando, expresamente, una factura rectificativa. Así se garantiza la autenticidad del documento en todo momento...
• Registro y trazabilidad. Al crear una factura se debe generar una huella digital (hash) que permita dejar constancia de cualquier cosa que le suceda (envío, cobro, anulación...) y "seguirle la pista".
• Conservación, legibilidad y accesibilidad. Las facturas se guardan y conservan en formato electrónico durante al menos 4 años y tienen que ser accesibles y legibles en cualquier momento, por si Hacienda necesita consultarlas.

Además, el programa también tiene que:

• Crear la factura en un formato electrónico oficial (Facturae, UBL), según la Ley Crea y Crece, para que la AEAT pueda leerla y procesarla fácilmente. 
• Poder incorporar la firma digital del documento, garantizando así que la factura cumple con toda la normativa.
• Tiene que estar certificado por el fabricante, quien declara que está cumpliendo con todos los requisitos legales.
• Ser compatible con Verifactu y mencionarse expresamente en el documento, para el envío de facturas a la AEAT en tiempo real.
• Incorporar un código QR para que se pueda comunicar a las autoridades fiscales y ser verificable.
• Debe poder exportar los registros y transmitirlos en línea.

Cuando se elige un programa de facturación, tan importante es cumplir con la legalidad, como que sea ágil, práctico y de fácil manejo para ti. 

Por eso, también necesitas que tenga determinadas funcionalidades que te harán más llevadero tu día a día, por ejemplo:

• Plantillas de facturación personalizables con tu imagen de marca.
• Creación de presupuestos, albaranes, facturas proforma y posibilidad de conversión a factura ordinaria.
• Envío de facturas a los clientes.
• Seguimiento del estado de los pagos para tener un mayor control sobre la caja.
• Gestión y tratamiento de datos de tus clientes y, también, de tus proveedores, para agilizar la carga administrativa y la contabilidad.
• Realización de informes tanto contables como financieros.
• Soporte técnico y formación para enseñarte a trabajar con él y resolver todas tus dudas e incidencias.
• Actualizaciones y mantenimiento porque de nada sirve tener un buen programa si después le cuesta adaptarse a los cambios legales y tecnológicos que se puedan producir.

Y, por supuesto, también tienes que valorar si el programa que has elegido se ajusta a tu presupuesto.

¿Es necesario cambiar ahora mi programa de facturación?

Es importante que sepas que, desde julio de 2025, todos los fabricantes y distribuidores de software de facturación están obligados a cumplir con la normativa y adaptar sus programas. Y da igual si es gratuito o de pago. 

Para ti como usuario, la cosa empieza un poco más tarde para darte tiempo y que lo implantes poco a poco:

• Para las empresas es desde enero de 2026.
• Para los autónomos y pymes a partir de julio de 2026.

Así que, si ya tienes un programa de facturación que te encanta, asegúrate de que cumple con todos los requisitos y podrás continuar con él.

Ahora bien, si tu programa no cumple con las nuevas normas o aún no tienes uno, te aconsejo que empieces a buscar desde ya para que no te pille el toro.

Y, para facilitarte la búsqueda, voy a proponerte las que creo que son las mejores opciones que ofrece el mercado.

Programas de facturación para autónomos

Lo mejor para un autónomo es encontrar el equilibrio entre la obligación de cumplir con la ley y poder utilizar un programa que te facilite el día a día. 

Por eso, te recomiendo elegir una plataforma SaaS (Software as a Service), que es un sistema de facturación online que te permite utilizarlo desde cualquier parte y dispositivo. 

Estas son algunas de sus ventajas:

• No necesitas instalar nada en local.
• Se actualiza automáticamente para adaptarse a los cambios legales.
• Guarda los datos en la nube y hace copias de seguridad.
• Tiene un soporte técnico muy accesible para ayudarte en caso de tener alguna duda o problema.

Por eso, suelen estar más preparados para el futuro que los tradicionales de escritorio.

Para ayudarte en tu elección, voy a darte algunas sugerencias de programas, que tienen una buena relación calidad, funcionalidad y coste.

 FacturaDirecta

Es una de las soluciones más recomendadas para autónomos y micropymes por su sencillez y claridad. Está especializada en facturación y gestión de impuestos y su diseño es perfecto para quienes no tienen conocimientos contables.

También ofrece una integración básica con gestores (asesorías). Tiene un plan gratuito con funciones muy limitadas y que no dispone de firma digital. Por lo que te recomiendo el plan básico con una prueba gratuita, que es más completo y ya te garantiza la firma.

Quipu

Es una plataforma “todo en uno” que te permite crear y gestionar tus facturas, además de la tesorería, impuestos y clientes. También te permite digitalizar documentos y tickets, y crear presupuestos y albaranes.

Puedes automatizar tareas recurrentes, rellenar modelos tributarios y realizar la conciliación bancaria.

Quipu se puede integrar con más de 200 aplicaciones y tiene una app móvil.

Tiene una prueba gratuita de 15 días y un plan starter muy económico.

Billin

Esta es una de las opciones más populares entre los autónomos, ya que se ha desarrollado pensando en ellos. Se conecta con la AEAT y es compatible con el nuevo sistema de facturación electrónica.

Además, es un programa VeriFactu 100% subvencionado por el Kit Digital, aunque también tiene planes muy económicos.

Con Billin puedes crear y enviar facturas, dispone de plantillas personalizables y diversas herramientas adicionales (calculadoras), CRM para la gestión de clientes, conectar con tu asesoría, etc. 

Holded

Es un programa algo más completo porque, además, permite controlar inventario, proyectos, etc., lo que le hace ideal si estás creciendo.

Cuida mucho tu relación con tus clientes, ya que permite que tus clientes tengan un portal personalizado para que puedan ver sus facturas, aprobar presupuestos, etc.

Tienes una prueba gratuita de 14 días y un descuento adicional para los 3 primeros meses. Puede que su coste sea un poco mayor al del resto de programas, pero tiene una funcionalidad superior que hace que merezca la pena.

Contasimple

Es un programa especialmente diseñado para autónomos, emprendedores, freelancers y pymes. Se integra muy bien con los e-commerce.

Con Contasimple puedes gestionar tu facturación, la contabilidad, los impuestos, clientes, proveedores, control de gastos e ingresos, adaptación a varios idiomas, etc.

Tiene un plan gratuito para siempre que te da acceso a las funcionalidades básicas esenciales del negocio con límite de movimientos. 

Los planes Profesional y Ultimate son más completos y pueden adaptarse mejor a tu actividad, por un coste muy ajustado.

a3factura

Tiene un diseño muy intuitivo que te permite crear facturas y presupuestos en pocos minutos, puede crear facturas desde albaranes y pedidos, gestiona tickets de papel, tiene plantillas personalizables y puedes crear las tuyas propias, controlar tu stock en almacén, etc.

Tiene una integración perfecta con tu gestor, destacando en el sector de las asesorías, y una app móvil desde la que también puedes trabajar y puedes compartirla con tu gestor de manera gratuita.

Otro punto a favor es que tiene sesiones de formación online para que puedas sacarle el máximo rendimiento a la plataforma.

Puedes realizar una prueba gratuita y los precios son muy asequibles.

Solución Oficial de la Agencia Tributaria (AEAT)

Hacienda está desarrollando su propio software de facturación que vas a poder utilizar gratuitamente y que, por supuesto, cumplirá la ley y sus especificaciones.

Este programa está orientado para autónomos y pequeños negocios que tengan pocas facturas, por lo que este sistema de facturación simplificada permitirá cubrir tus necesidades básicas sin necesidad de tener que invertir en un software externo.

Se espera que esté disponible en breve para que autónomos y pequeñas empresas puedan empezar a utilizarlo lo antes posible.

Tabla resumen de los programas de facturación

Programa	¿Tiene opción gratuita?	Lo mejor de este software
FacturaDirecta	✔️Plan gratis limitado y prueba gratuita de 30 días para los planes.	Muy fácil de usar, buena integración bancaria.
Quipu	✖️Tiene prueba gratuita de 14 días para sus planes.	Todo en uno: impuestos, digitalización, CRM.
Billin	✔️Funciones básicas.	Muy adaptado a autónomos y normativa actual.
Contasimple	✔️Funciones básicas.	Ideal para autónomos con e-commerce.
Holded	✖️Tiene prueba gratuita de 14 días y descuentos en sus planes.	Funcionalidades avanzadas: CRM, inventario.
a3factura	✖️Tiene prueba gratuita de 30 días en sus planes y son muy económicos.	Diseño intuitivo, buena conexión con gestorías.
AEAT (oficial)	✔️	Gratuito, básico y pensado para autónomos con pocas facturas.

Estos son algunos de los programas disponibles en el mercado que puedes consultar para elegir el que más te convenga.

En cualquier caso, si tienes alguna duda o necesitas asesoramiento, no dudes en dirigirte a profesionales como Openges que puedan orientarte para que tu facturación sea ágil, eficiente y conforme a la legalidad.